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現在研究中の治療法
# 寄生虫の卵を服用する方法(アイオワ大学、ジョエル・ワインストック医学博士 Joel Weinstock をリーダーとするチームにより研究されている)。豚に寄生する鞭虫の卵を服用。
# 順天堂大学医学部附属順天堂医院 大草敏史の研究によるフソバクテリウム・バリウム(Fusobacterium varium)をターゲットとした除菌療法(抗菌薬3剤併用療法、ATM療法)が2003年より臨床試験中【PR】
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治療
 薬物療法
    * サラゾスルファピリジン(サラゾピリン(R))やメサラジン(ペンタサ(R))。経口薬として。メサラジン(5-ASA)はサラゾスルファピリジン(SASP = SP + 5-ASA)から SP を取り除き、有効成分 5-ASA を取り出した新薬。そのままではサラゾスルファピリジンの方がメサラジンよりも直腸に届きやすいが、メサラジンは徐々に溶出する「徐放剤」として剤形を作ってある。似た薬であるが、患者の症状によりいずれかが適宜処方される。メサラジンはサラゾスルファピリジンよりも副作用が少ないとされている。
    * メサラジン。注腸薬として。ペンタサ注腸(R)。
    * 非特異的な免疫抑制療法
o ステロイド製剤
    + プレドニン。経口薬・静注薬以外には、注腸薬としてステロネマ注腸(R)・プレドネマ注腸(R)。

注腸では全身投与でないので投与量が少なくて済み、副作用が少ない利点があるが、大腸全体の炎症抑制に効くことは期待できない。
    + 坐剤として。リンデロン坐剤。
o 免疫抑制剤:シクロスポリン、アザチオプリン
    * 漢方薬による治療を行っている病院もある。
    * プレドニゾロン強力動注療法
    * ACTH静注

白血球除去療法
リンパ球除去療法 (LCAP)、顆粒球除去療法(GCAP)など。患者の体外に血液を循環させて装置を通し、炎症を起こす免疫細胞(好中球など)を血中から取り除いた後に体内に返す。薬物療法のみでコントロールできない患者に対して行われる。患部が比較的広い場合には効果が期待できるが、患部が直腸のみなど狭い場合には効果はあまり期待できない。

外科療法
手術の絶対適応として、劇症、中毒性巨大結腸症、穿孔、大出血、癌化などがある。特に癌化をのぞく4つは緊急手術の適応となる。手術としては結腸全摘が行われる。

前述の内科的治療(薬物療法やLCAP・GCAP)による炎症のコントロールが不良で、下痢・腹痛(がもたらす精神的苦痛)や貧血状態が続くときは、活動性ある部分の腸管を切除する[2]。

また、活動性が比較的低くとも、炎症が持続している病変部は将来癌化する恐れが大きいので、予防的に切除することもある。特に、生検で異形成が認められた場合はリスクがより高い(或いは既に、検体を採取しそこねた場所に癌が生じているかも知れない)ため、積極的な外科的治療の適用となる。

栄養療法
重症の患者に対しては腸管からの栄養摂取が不可能であるため、高カロリー輸液での栄養摂取を行う。クローン病においては栄養療法の有効性が示されているが、当疾患において栄養療法(絶食療法)が有効であるという科学的なデータは示されていない。また、特定の食品が症状を抑えるかは明かではない[3]。「ω3脂肪酸、n-3脂肪酸を豊富に含む魚油サプリメントは、炎症を軽減し抗炎症薬を減らす」との報告があるが、データが少なくさらなる研究が必要[4]とされている。また、プロバイオティクの有効性は統計学上の有意な差は無い[5]の報告もなされている。

一般的に、「脂肪摂取量を減らす」、「蓚酸(シュウ酸)を含む植物を避ける」、「繊維質の少ない食事」、「タンパク質の摂取は肉より魚」、「刺激の強いものは避ける」、「アルコールは避ける」、「乳製品は避ける」などと言われている。
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所見
消化管造影
    注腸バリウム造影により、大腸の鉛管状変化(ヒダがみられなくなる)、偽ポリポーシス(粘膜が脱落し、残った部分がポリープのように見える)が特徴的とされる。
大腸内視鏡
    腸管粘膜のびまん性炎症、白苔の付着などをみとめる。
炎症の分布
    炎症は大腸の下部から上部へ向かって連続性に広がる。炎症自体は浅い潰瘍が広く広がる形をとる。
組織病理学的所見
    顕微鏡的には、あたかも大腸粘膜の上皮を標的とした自己免疫疾患のような形態をとる。活動期には、粘膜上皮細胞の間に好中球が浸潤して上皮を破壊し、特に粘液を分泌する杯細胞の減少が目立つ。上皮がくぼんだ部分=陰窩(いんか)の中に溜まって微小な膿瘍を形成しやすい。粘膜固有層には形質細胞などが密集した、強い慢性炎症の像をとる。通常は粘膜に限局し、固有筋層に炎症が及ぶことは比較的稀である。
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合併症
大腸以外にも関節や皮膚、眼などに合併症が生じることが知られている。これは免疫異常が関係していると考えられている。

    * 強直性脊椎炎
    * 結節性紅斑
    * 壊死性膿皮症
    * ブドウ膜炎
    * 虹彩炎
    * 原発性硬化性胆管炎
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症状
粘血便、下痢、腹痛、発熱などがある。若年者でこれらの症状をみた際には潰瘍性大腸炎を疑って精査する必要がある。

合併症として腸閉塞、腸管穿孔をおこして緊急手術が必要となる場合がある。 また、潰瘍が深くなって固有筋層に及び、広い範囲の腸管神経叢(固有筋層の中層にある)が露出すると腸管の収縮機能が失われ、大腸の拡張をみるようになる。この状態が中毒性巨大結腸症であり、穿孔の危険もあるため腸管摘出が必要となる。

また、罹患中、治癒後とも大腸癌の合併頻度が高い。この大腸癌は未分化で浸潤性が強く、悪性度の高いことが多い。
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